依據(jù)對微生物控制的程度，潔凈動物房可分為開放體系、屏障體系和阻隔體系3類。開放體系養(yǎng)殖一般動物;屏障體系養(yǎng)殖無特定病原動物（ SPF動物）；阻隔體系養(yǎng)殖無菌動物及悉生動物。一般除一般動物房外均為潔凈動物房。
選址：潔凈動物房應(yīng)建在環(huán)境清潔安靜，地勢高燥，排水、通風(fēng)良好，水、電供應(yīng)有保障的當(dāng)?shù)?。盡量遠(yuǎn)離工廠、繁華居民區(qū)、屠宰廠、畜禽場，以及有疫源要挾和公害污染的地區(qū)。出產(chǎn)和科研單位的動物房宜單獨(dú)建筑在一個(gè)小區(qū)內(nèi)，與其他部門阻隔。
SPF級潔凈動物房
布局：潔凈動物房一般由養(yǎng)殖室、健康調(diào)查室、阻隔檢疫室、各種試驗(yàn)室（外科手術(shù)、試驗(yàn)處理解剖、術(shù)后辦理、疾病診斷、治療、生理生化檢查、微生物檢疫、飼料養(yǎng)分剖析和特別飼料的調(diào)制室等），以及貯藏室、清潔預(yù)備室、洗滌消毒室、工作人員用房（包含辦公室、淋浴室、更衣室等）、走廊(清潔區(qū)和污染區(qū))、廢棄物處理設(shè)施、機(jī)房和變電所等組成。其平面布置，應(yīng)使人、動物和物品的活動路線合理，作業(yè)便利。嚴(yán)厲區(qū)分清潔區(qū)域和污染區(qū)域，以保證人和動物的健康，保證試驗(yàn)的準(zhǔn)確性（人、動物和物品的活動路線見圖）。養(yǎng)殖室的平面尺寸依據(jù)養(yǎng)殖量、養(yǎng)殖方法，籠具架規(guī)格、排列方法、室內(nèi)環(huán)境、養(yǎng)殖辦理及操作方法等綜合研討確認(rèn)。為了防止溫、濕度在筆直方向呈現(xiàn)梯度,籠架高度不宜超過1.8米,頂棚高應(yīng)在2.2～3米范圍內(nèi)。走廊寬度要便于操作和轉(zhuǎn)移物料及器件,以不小于1.3米為宜。清潔預(yù)備室的巨細(xì),須依據(jù)作業(yè)內(nèi)容和消毒滅菌裝置等設(shè)施占用的空間確認(rèn)。
建筑：試驗(yàn)動物房不該受到外環(huán)境污染，應(yīng)有較高的潔凈度，并且為密閉、室內(nèi)墻壁、頂棚、地面應(yīng)光滑易清潔，不留死角，盡量少開洞。因此，傳統(tǒng)做法是在試驗(yàn)室的建設(shè)中，其墻面、頂棚均選用防火彩鋼板，地面為環(huán)氧樹脂自流平3㎜厚，接口密封后選用鋁合圓角處理。
氣壓：潔凈動物房要求無菌、無污染性及其對工作人員及外環(huán)境基本不產(chǎn)生危害，它在氣壓、氣流設(shè)計(jì)安排上應(yīng)為有高到低即：清潔走廊（50Pa）→工作室（35Pa）→污染走廊（20Pa）→前處理室（10Pa），通過集中排風(fēng)管道，經(jīng)適當(dāng)中和處理排向大氣。此外由于試驗(yàn)動物在其調(diào)查養(yǎng)殖及試驗(yàn)階段對其生活環(huán)境條件具有較高的要求，在潔凈度、溫度、濕度、風(fēng)速、照度等方面要求較高，因此在其設(shè)計(jì)和建造中也是應(yīng)該考慮的重要因素之一。
消毒：物料進(jìn)出試驗(yàn)室要消毒處理，潔凈動物房一般選擇過墻傳遞式高壓滅菌消毒鍋。
